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A、原子是由为原子核和核外电子构成的,原子核是由质子和中子构成的,但是有的原子中没有中子,故A错;
B、一种原子和另一种原子的本质区别是质子数不同,即原子的类别是由原子核内的质子数所决定的,故B正确;
C、原子是由为原子核和核外电子构成的,原子核是由质子和中子构成的,一个质子带一个单位正电荷,中子不带电,在原子内核内质子数等于核外电子数,一个电子带一个单位负电荷,所以原子核所带电量和核外电子所带的电量相等,电性相反,所以整个原子不显电性.故C错;
D、原子核的体积只占整个原子体积的几万分之一,但却集中了整个原子的主要质量,因为电子质量太小,可以忽略不计,故原子的质量主要集中在原子核上,即原子的质量主要集中在质子和中子上;故D错.
故选B.